Biegunka - czyli sytuacja, jeśli w ciągu dnia mają miejsce więcej niż 3 wypróżnienia - najczęściej pojawia się w efekcie zbyt szybkiego pasażu jelitowego lub zaburzeń wchłaniania substancji odżywczych, a także podczas zwiększonego wydzielania wody i elektrolitów ze ściany jelita do jego środka. Z kolei do zaparć może dochodzić na skutek zbyt wolnego pasażu jelitowego (np. z powodu złej diety), ale również w związku z chorobą. Zmiany w konsystencji stolca mogą świadczyć o zakażeniu układu pokarmowego, nietolerancji pokarmowej, celiakii, zespole jelita drażliwego, zespole SIBO, uchyłkach jelita, wrzodziejącemu zapaleniu jelita grubego czy chorobie Leśniowskiego - Crohna.